L'épreuve de qualification a eu lieu dans tous les collèges inscrits le jeudi 13 mars 2008.
Treize collèges du département de la Côte-d'Or étaient inscrits à l'épreuve de qualification. Tous sont qualifiés pour participer à la grande finale du samedi 17 mai à Is-sur-Tille. Parmi les élèves retenus pour représenter leur collège, aucun n'a fait plus d'une faute, la majorité ayant réussi le sans-faute. Le faible écart entre les candidats qualifiés est la garantie d'une compétition ouverte et équilibrée.
Certains collèges ont deux équipes qualifiées, en fonction des résultats obtenus par leurs candidats (premier critère : nombre de fautes, deuxième critère : temps de résolution.)